Im Jahr 2007 vorgestellt, besitzt der Fabia II ein von Jozef Kabaň gezeichnetes, moderneres Design und nutzt die überarbeitete Konzernplattform PQ24. Größer und umfangreicher ausgestattet als das Vorgängermodell, setzt er sich gegen die Peugeot 207 dank seines großzügigen Innenraums und eines Kofferraums an der Spitze des Segments durch.
Das Motorenprogramm erweitert sich um den effizienten 1.2 TSI mit 86 PS sowie den sparsamen 1.6 TDI in den Leistungsstufen 75 und 90 PS. Der 2009 auf den Markt gebrachte Combi Scout bringt eine erhöhte Bodenfreiheit sowie robuste Kunststoffbeplankungen mit - geschätzt von aktiven Familien.
Das Facelift von 2010 bescherte der Modellreihe eine überarbeitete Frontpartie und verbesserte die Geräuschdämmung spürbar. Bei der Inspektion erfordert der Zahnriemen des 1.2 TSI Aufmerksamkeit, ebenso wie die Steuerkette der kleineren 1.2-Benziner, die zu vorzeitiger Längung neigen kann. Die vorderen Radlager sollten bei Exemplaren mit hoher Laufleistung regelmäßig gecheckt werden.